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基于稳定同位素标记的蛋白质组学定量方法研究进展

何力妍 | -> | 539| 1| 0.562789MB |定量蛋白质组学,稳定同位素标记,相对定量,绝对定量

何力妍 何力妍 | 文档量 |浏览量7642

摘要: 定量蛋白质组学已经成为后基因时代的重要研究方向之一。目前该领域的研究主要采用无标记定量方法和稳定同位素标记定量法。其中,基于稳定同位素标记的蛋白质组定量方法发展非常迅速,已为生命科学研究提供了重要的技术支撑。本文分析了基于稳定同位素标记的蛋白质组学定量方法,包括相对定量方法和绝对定量方法,并对其发展进行了展望。
    对细胞、组织和整个生物体的表达蛋白质进行定量分析是后基因时代面临的主要挑战之一[1]。蛋白质组定量分析可以分为相对定量和绝对定量[2]。相对定量是研究不同情况下同一蛋白质组样品组成含量的变化,如细胞受到刺激前后蛋白质表达的差异; 绝对定量是研究样品中目标蛋白质的具体量,如拷贝数或浓度。
    早期的蛋白质组定量主要利用双向凝胶电泳或双向差异凝胶电泳来实现。虽然该方法对蛋白质分离具有较高的分辨率,然而无法对疏水、低丰度和翻译后修饰蛋白质进行定量。近年来基于液相色谱-串级质谱联用的方法得到了快速发展,已成为蛋白质组定量的主流技术。该方法可以分为无标记定量法和稳定同位素标记定量法。其中,基于稳定同位素标记的蛋白质组定量方法可以在不同步骤实现样品混合,可以同时实现多重标记及消除色谱-质谱联用分析过程中不稳定性带来的定量误差等优点,已成为定量蛋白质组学研究中最常用的方法。
    根据同位素引入的方式,基于稳定同位素标记的蛋白质组定量方法可以分为代谢标记法、化学标记法和酶解标记法。采用不同方法,标记同位素的样品在不同步骤混合; 越早混合,样品预处理步骤引入的误差越小,定量的准确度越高。进行相对定量时,采用代谢标记法则样品在细胞水平混合; 采用化学标记法则样品在蛋白质或者肽段水平混合; 采用酶解标记法则样品在肽段水平混合。进行绝对定量时,样品在蛋白质或者肽段水平混合( 见图1) 。本文结合近期发表的文献,对基于稳定同位素标记的蛋白质组定量方法进行综述和评述。
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