0
关键词：
涕灭威,降解菌,土壤微生物
发表时间：
2012-06-20 16:49:13
摘 要: 酮醇酸还原异构酶( KAR I)是一个有前景的除草剂靶标酶, 有关其抑制剂的设计研究鲜有报道。在文献报道的菠菜KAR I酶复合物0. 165 nm 高分辨率晶体结构基础上, 利用分子对接DOCK 4. 0方法进行MDL /ACD 三维数据库搜寻, 得到了279个与KARI酶结合能较低的小分子结构信息, 并从中选取部分小分子进行化学合成, 进而测试了其除草活性。在合成的17个化合物中, 发现个别化合物对油菜(抑制率70. 8% ) 和稗草(抑制率48. 8% )具有较好的生长抑制活性。
K eto-l ac id reducto isom erase( KAR I)是支链氨基酸生物合成的关键酶之一, 同AL S酶一样, 它可以作为设计除草剂的靶标酶, 通过抑制酶的活性中断支链氨基酸的合成而使植物死亡, 从而达到除草目的。人畜体内自身不合成支链氨基酸, 因此靶向KAR I酶的抑制剂设计工作符合绿色农药的发展方向。有关KAR I酶研究进展作者也曾做过综述[ 1] 。
迄今为止, 所报道的KAR I酶抑制剂的种类和数量稀少, 主要为KAR I所催化的天然底物类似物Hoe 704[ 2] 和IpOHA [ 3] 、1, 2, 3-噻二唑类化合物[ 4]以及一些环丙烷衍生物等。这些抑制剂抑制能力均表现为时间依赖性, 在体外( in v itro )具有较高的酶抑制活性, 而在体内( in v ivo )的除草活性却很微弱,其原因是酶和抑制剂结合缓慢或存在底物的竞争行为。到目前为止尚没有一个商品化的靶向KAR I酶除草剂问世, 因此有关KAR I抑制剂的研究还有很大的潜力。可喜的是, 法国的B iou等1997年首次报道了KAR I-IpOHA 复合物的0. 165 nm 高分辨率的晶体结构[ 5], 这为基于结构的药物设计( structure-based drug design)提供了新的机遇。
基于KAR I酶的研究背景和现状, 作者利用计算机辅助药物分子设计方法) ) ) 基于结构的药物设计( SBDD ) , 以菠菜KAR I复合物0. 165 nm 高分辨率晶体结构为基础, 首次利用DOCK 4. 0 分子对接程序通过MD L /ACD 三维数据库搜寻, 从250 000个化合物库中找到了279个与KARI结合能较低的小分子, 对部分化合物进行化学合成与结构表征, 进而进行生物活性测试。这些结果将为今后KAR I酶抑制剂的设计工作提供信息。所报道的化合物结构式见图1。
基于KAR I酶的研究背景和现状, 作者利用计算机辅助药物分子设计方法) ) ) 基于结构的药物设计( SBDD ) , 以菠菜KAR I复合物0. 165 nm 高分辨率晶体结构为基础, 首次利用DOCK 4. 0 分子对接程序通过MD L /ACD 三维数据库搜寻, 从250 000个化合物库中找到了279个与KARI结合能较低的小分子, 对部分化合物进行化学合成与结构表征, 进而进行生物活性测试。这些结果将为今后KAR I酶抑制剂的设计工作提供信息。所报道的化合物结构式见图1。
牛润峰发布的其他共享资料
-
-
关键词： 稀有放线菌,选择性分离,抗菌活性 发表时间： 2012-06-20 16:47:56
-
关键词： 酮醇酸还原异构酶,合成,除草活性 发表时间： 2012-06-20 16:46:18
-
关键词： 天名精内酯酮,结构修饰,抑菌活性 发表时间： 2012-06-20 16:44:59
-
关键词： 苏云金芽孢杆菌,铜绿丽金龟,黄褐丽金龟,生长发育,拒食作用 发表时间： 2012-06-20 16:43:53
-
关键词： 苏云金杆菌,营养期杀虫蛋白,活性,Vip3A-LS1基因克隆 发表时间： 2012-06-20 16:42:23