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铁皮石斛野生居群基于RAMP标记的遗传多样性评价

赵虎 | -> | 1338| 1| 1.023585MB |铁皮石斛,居群,遗传多样性,RAMP

赵虎 赵虎 | 文档量 |浏览量46559

摘要: 本文运用RAMP 标记16 对引物组合, 对铁皮石斛9 个野生居群的112 个样本进行了检测, 共得到123条扩增带, 其中86 条 (占69.92%) 具有多态性, 每对引物组合可扩增出3~8 条多态性带, 平均5 条, 表明铁皮石斛不同居群间存在较丰富的遗传多样性; 铁皮石斛居群间遗传相似系数的变化范围为0.250~0.813, 平均值为0.550。利用RAMP 扩增条带数据进行聚类分析, 可将9 个铁皮石斛野生居群划分为3 个类群, 聚类结果表现出较好的地域相关性, 显示RAMP 标记可以有效地评价铁皮石斛野生居群的遗传多样性及遗传结构。
    RAMP (random amplified microsatellite polymorphism)是一种建立在PCR 基础上的DNA分子标
记技术, 由Wu 等[1, 2]于1994 年提出并应用。与SSR(simple sequence repeats) 相比[3], RAMP 操作简单, 不需克隆、测序来设计特殊双引物; 与RAPD (random amplified polymorphic DNA) 相比[4], RAMP 更能真实反映品种间的亲缘关系, 且更适合遗传背景尚不太清楚的物种。RAMP 标记不仅被成功应用于蕺菜属 (Houttuynia)[5]、仲彬草属 (Kengyilia)[6]、赖草属(Leymu)[7]等属植物的遗传多样性研究, 还被应用于无花果 (Ficus carica)[8]、海枣 (Phoenix dactylifera)[9]、赤豆 (Vigna angularis)[10]等栽培种种内的遗传多样性及遗传关系的研究以及植物资源的鉴定[11, 12]。
    铁皮石斛 (Dendrobium officinale Kimura et Migo)是我国兰科 (Orchidaceae) 石斛属 (Dendrobium) 珍稀濒危特有种, 主要分布于云南、广西、广东、贵州、湖南、浙江、福建、江西等南方省份。铁皮石斛作为药材应用历史悠久, 在我国被列为“中华九大仙草”之首, 为《神农本草经》中的上品, 具有滋阴清热、生津益胃、润肺止咳、抗癌防老等功效[13, 14]。近年来, 由于铁皮石斛保健品和药品的开发, 致使铁皮石斛野生资源日趋匮乏, 铁皮石斛处于极度濒危状态[15], 利用分子遗传标记研究其野生居群的遗传多样性和遗传结构, 直接关系到铁皮石斛保护策略能否得到正确的制定[16, 17]。
    鉴于铁皮石斛野生资源濒临灭绝, RAMP 技术尚未应用于铁皮石斛野生居群的遗传多样性分析, 本
文拟采用RAMP 技术, 对铁皮石斛野生居群进行遗传多样性及亲缘关系的分析, 为铁皮石斛野生资源的合理保护和可持续利用提供理论依据。
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