基于液相色谱-质谱联用技术的肺癌细胞代谢组学分析

马耀飞 | -> | 738| 8| 0.341699MB |高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱,偏最小二乘判别分析,代谢组学,肺癌

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摘要: 通过高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱( HPLC-Q-TOF/MS) 分别对肺癌细胞与正常细胞的极性与非极性代谢物进行指纹图谱分析,进一步应用偏最小二乘判别分析( PLS-DA) 对代谢组学数据进行多维统计分析。研究结果显示,与正常细胞相比,肿瘤细胞存在异常的蛋白质、脂肪酸、磷脂代谢,并发现31 种对分类有显著贡献的代谢小分子物质。通过本研究,建立了基于液相色谱-质谱联用技术的肺癌细胞代谢组学分析方法,发现了肺癌潜在疾病标记物,可为肺癌分子标记物的发现及其早期诊断提供新思路和新方法。
    根据世界卫生组织报告,每年全球有上百万人死于肺癌。肺癌原位癌治愈率接近100%,但由于肺癌早期临床表现不明显,大部分患者确诊时已属晚期,只能采用姑息治疗,预后较差,总的5 年生存率约10%~ 15%[1],因此,发展有效的早期诊断方法无疑能使患者尽早得到治疗,明显改善患者预后,延长肺癌患者的生存时间。目前肺癌诊断的常用方法有影像学检查方法、痰脱落细胞学检查和支气管镜检技术[2],这些方法容易造成漏诊与误诊,且仪器价格昂贵,不适合作为肺癌早期筛查手段。
    近年来,随着系统生物学的飞速发展,肿瘤标志物的识别已成为恶性肿瘤早期诊断的研究热点。肿瘤标志物是指在肿瘤发生和增生过程中,由肿瘤细胞生物合成、释放或者是肿瘤与宿主相互作用而产生的一类物质,其最终导致体内的代谢物质发生变化[3]。代谢组学可以对肿瘤发生发展过程中的所有代谢物进行定性和定量分析,并能识别未知代谢产物[4]。这种方法已经成功地应用于乳腺癌[5]、前列腺癌[6]的肿瘤标志物识别中,对建立肺癌的早期诊断方法具有重要的参考价值。
    目前肺癌早期标志物的代谢组学研究主要通过对比肺癌病人与健康人的血液或尿液,但在很多代谢过程中,代谢产物个体差异大,极易受到饮食、环境、年龄和其他疾病等因素的干扰,在如此复杂的背景下识别疾病标志物极有难度。而以肿瘤细胞作为代谢组学研究对象,通过细胞代谢物的差异表达寻找潜在的特异性疾病标记物,可以避免常规实验中样本个体差异与复杂性问题,是一种极有前景的技术方法。Sheikh 等[7]考察了细胞培养与提取方法对代谢物的影响,Gao 等[8]考察了细胞脂质代谢物的提取方法和条件,这些研究都为开展细胞代谢组学研究提供了基础,但相关研究国内外尚无报道。
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