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枫斗类石斛cpDNApsbA_trnH的序列分析与鉴别

王雪梅 | -> | 1191| 0| 0.660246MB |石斛属.枫斗类石斛.psbA-trnH.分子鉴别

王雪梅 王雪梅 | 文档量 |浏览量40283

摘要: 本研究对常见枫斗类石斛cpDNA 的psbA-trnH 区进行了测序, 利用MEGA 4.0 对该区序列进行了比较分析。结果显示: 15 种常见的枫斗类石斛的psbA-trnH 序列长度为721~767 bp, 变异位点42 个, 简约信息位点11 个。以Kimura-2 参数计算遗传距离, 常见枫斗类石斛的种间遗传距离为0.001 3~0.018 3, 平均遗传距离为0.014 8。不同石斛种间均存在序列差异, 全序列中共出现6 处indels, 导致种间片段长度差异较大; 暂未发现所检测的枫斗类石斛居群间在psbA-trnH 区的序列存在差异。利用枫斗类石斛psbA-trnH 序列数据库及遗传分析软件, 通过对待检种的psbA-trnH 序列的测定, 成功鉴别了待检种。cpDNA 的psbA-trnH 区可作为枫斗类石斛分子鉴别的候选标记。
    石斛为传统名贵中药材, 早在《神农本草经》中就被列为上品, 有滋阴清热、生津益胃、润肺止咳等功效[1]。根据形态特征和加工规格的不同, 可分为枫斗类石斛和黄草类石斛等[2]。然而, 石斛类药材的鉴别一直是“医工难辨”, 对于枫斗类石斛来说, 无论是鲜品状态下还是其加工后的产品形态上都十分相似, 很难通过形态学加以鉴别[3]。枫斗类石斛种间的化学成分存在差异, 价格差异很大, 功效也不尽相同。不法商家为了牟取暴利, 经常出现以假乱真、以次充好的行为, 造成了枫斗类石斛药材市场的混乱,因此, 枫斗类石斛的基源鉴别突显重要。
    近年来, DNA 分子标记技术得到了迅猛发展, 其中DNA 序列因其能够提供可靠的种间鉴别依据, 不断被用于中药材的种间鉴别研究。psbA-trnH 位于编码光合系统Ⅱ反应中心的D1 蛋白的psbA 基因和编码tRNA组氨酸的trnH基因之间, 被认为是被子植物叶绿体基因组中变异位点最多的序列之一。对于有花植物来说, psbA-trnH 展现了很好的种间鉴别价值[4]。本文拟运用叶绿体基因组psbA-trnH对常见枫斗类石斛的序列进行分析与比较, 为枫斗类石斛的DNA 分子鉴别提供鉴别依据。
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