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珍稀铁皮石斛SSR标记的开发及种质纯度鉴定

张鑫 | -> | 1375| 0| 0.849583MB |铁皮石斛,微卫星标记开发,通用性检测,纯度鉴定

张鑫 张鑫 | 文档量 |浏览量33474

摘要: 本研究利用磁珠富集法开发了60 对铁皮石斛的SSR 引物, 从中筛选出15 对多态性位点丰富、带型
清晰、重复性好的引物。利用筛选出的SSR 引物对铁皮石斛野生居群材料进行了遗传分析, 共鉴定出等位变异92 个, 平均每个SSR 位点等位变异数为6.1 个; 表观杂合度 (HO) 范围是0.60~0.85, 平均值为0.72; 期望杂合度 (HE) 范围是0.49~0.85, 平均值为0.74。平均每个SSR 位点多态信息含量 (PIC) 为0.702, 变化范围为0.437~0.829。利用15 对SSR 引物对20 种石斛试验材料进行跨种扩增, 检测出有13 对SSR 引物具有种间通用性。此外, 还利用所筛选的4 对SSR 引物检测了集约化种植过程中的铁皮石斛组培苗的种质纯度, 结果显示: 所开发的SSR 标记可用于铁皮石斛组培苗的品种纯度鉴别。
    石斛属 (Dendrobium Sw.) 为兰科 (Orchidaceae)第二大属多年生草本植物, 全球约有1 000 余种, 主要分布于亚洲热带和大洋洲地区[ 1 ]。铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo) 为我国特有的石斛属药用植物, 早在《神农本草经》中就有记载,具有滋阴生津、润肺明目、抗癌防老等功效[2]。近年来, 由于铁皮石斛保健品和药品的大规模开发, 不但使其野生资源遭受毁灭性的破坏, 而且还导致了铁皮石斛混淆品的泛滥, 因此亟须建立有效的铁皮石斛种质鉴别的可靠手段[3−6]。目前石斛属植物已有很多成功的分子鉴别方法。丁小余等[7]建立了枫斗类石斛的rDNA ITS 区全序列数据库, 利用该数据库对枫斗类石斛待检种准确鉴别; 邵世光等[8]通过对枫斗类石斛cpDNA psbA-trnH 序列的测定, 成功鉴别了待检种; 刘静等[9]对12 种石斛的matK 基因全序列进行测定, 可以对石斛不同种及种内不同居群 (品种) 进行鉴别。
    准确鉴别药用植物的种质是实施药材良好农业规范 (good agricultural practices, GAP) 的关键, 必须依靠先进、简便、可靠的分子标记技术[10]。SSR (simple sequence repeat) 分子标记又称微卫星 (microsatellite)标记, 由1~6 个核苷酸的重复单位组成, 为长达几十甚至上百个核苷酸的串联重复序列, 广泛分布于整个基因组的不同位置上[11]。在植物基因组中, 由于微卫星寡核苷酸的重复次数在同一物种的不同基因型间具有差异且相对稳定保守, 因而SSR 标记呈现高度多态性, 可用于植物种质的鉴别[12, 13]。本文拟开发、筛选铁皮石斛的SSR 标记, 并对铁皮石斛组培苗的种质纯度进行鉴定, 为铁皮石斛种质的GAP 生产及保护奠定基础。
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