二维阵列色谱分离系统及其在血浆蛋白质组中的应用_黄志

宋丹杨 | -> | 393| 0| 1.161969MB |多维色谱;阵列色谱;高丰度蛋白质;蛋白质均衡器;血浆

宋丹杨 宋丹杨 | 文档量 |浏览量232106

    在人类基因组计划完成后,生命科学研究领域进入了功能基因组时代[CIl。血浆是临床医学中最为
常用的检测样本,因而成为蛋白质组学研究的热点对象。但在血浆样品中,蛋白质的浓度分布超过
10个数量级,20种高丰度蛋白质的含量占总蛋白质的99%以上[Cz, 37。由于低丰度蛋白质在质谱鉴定中
易受高丰度蛋白质掩盖效应的影响,因此必须对血浆样品中的高丰度蛋白质进行去除,以提高低丰度蛋
白质的鉴定能力[C4, 5]
    相较于免疫亲和柱去除高丰度蛋白质[6 - 9],基于多维液相色谱去除高丰度蛋白质是一种通用型的
样品预处理技术,一次运行可以去除数十种未知的高丰度蛋白质[[I0, I I]。采用基于该技术原理的强阳离
子交换色谱刊泛相高效液相色谱(SCX}PLC)二维分离系统,成功对鼠肝样品进行了蛋白质水平的高效
分离,一次性去除了58种高丰度蛋白质,鉴定得到的中低丰度蛋白质数提升了3倍[D of。本课题组最新
构建的在线阵列式二维常规柱液相色谱系统,己成功应用于在蛋白质水平上进行血浆样品完整蛋白质
的分离,大幅缩短了样品的全二维分离时间,对血浆样品中高丰度蛋白质的去除以及血浆样品的深入研
究具有较高的应用潜力[[12]。
    无论采用何种高丰度蛋白质去除方法,在去除的高丰度蛋白质馏分中都会夹带一部分与高丰度蛋
白质有相互作用的低丰度蛋白质。因此,从高丰度蛋白质馏分中富集低丰度蛋白质仍是一个难题[00
蛋白质均衡器技术[[14]具有与各种蛋白质相互作用的能力和机会均等的特点,从而可降低馏分中高低丰
度蛋白质的范围,实现低丰度蛋白质的富集。血浆样品经过蛋白质均衡器材料Ampholine @ PM处理
后,鉴定得到的蛋白质数目提高了1倍[[I 5]
    本研究采用在线二维阵列式液相色谱系统对血浆样品进行蛋白质水平的分离,大幅缩短降低二维
分离时间,实现高通量快速分离。针对低丰度蛋白质在质谱鉴定中易被高丰度蛋白质掩盖的问题,血浆
样品在在线二维阵列式色谱分离时,对高丰度蛋白质进行了快速定位并将高丰度蛋白质馏分和低丰度
蛋白质馏分分别进行后续处理。为了进一步提高低丰度蛋白质的鉴定效果,采用均衡器材料进行高丰
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