枯草芽孢杆菌代谢组样品前处理方法的比较研究_王洪彬
SDY | -> | 420| 0| 0.94209MB |代谢组学;枯草芽抱杆菌;气相色谱领谱联用;前处理
围的宽广性,检测尽可能多的代谢物及其含量始终是一个巨大的技术挑战[D.zl。尽管代谢组分析技术
近年来获得了快速发展[Cs - s7,但是在代谢组样品制备环节仍然存在诸多问题Cs-of。代谢组学分析技术
主要包括核磁共振(NMR)、气相色谱领谱联用(GC }VI S)和液相色谱领谱联用(LC }VIS)技术。NMR技
术具有样品处理简单、样品破坏性小等优点,但是相比质谱技术灵敏度较低,检测动态范围比较窄。LC-
MS技术的代谢物适合范围广,可以与多种质谱联用,灵活性和普适性好,但是缺乏完备成熟的标准谱图
库,难以高效准确地鉴定代谢物。采用GC }VIS技术,难挥发性样品需要衍生化,样品处理相对繁琐,但
是其有最完整的标准图库,代谢物谱图可检索性较强,定性鉴定方便,因此在代谢组学研究中应用广泛。
基于GC }VIS的代谢组学分析方法,其样品前处理环节包括淬灭、破碎提取和衍生等步骤,各个步骤
对分析质量都有较大的影响。理论上,一种代谢组样品处理方法无法适合于所有种类的的微生物,因
为不同种类微生物的细胞结构不同。目前,关于微生物代谢组研究有许多报道,但所采用的样品处理
方法在细胞淬灭、破碎和衍生化等步骤存在诸多差异。如在样品淬灭环节采用不同的溶剂,主要是
60%甲醇或者在60%甲醇中添加一定比例的盐Dz-ial。液氮冷冻也是细胞淬灭的常用方法〔i al,但主要
用于动植物组织样品的处理,由于该法无法分开胞内外物质,因此不适于微生物代谢组的研究。细胞破
碎方法,主要有珠磨法、超声破碎法和液氮研磨法等os.}6}。在样品衍生化环节可以采用不同的衍生试
剂,其中Obis巨甲基硅烷」三氟乙酸盐( MSTFA)作为衍生剂使用比较广泛,文献报道中其衍生时间不
尽相同[i}-zil
枯草芽抱杆菌是一种重要的工业微生物Czzl,广泛应用于蛋白酶和淀粉酶等酶制剂的生产、废水处
理、饲料和益生菌行业,同时它也是基础研究领域重要的模式微生物,常用于研究芽抱的形成机制。因
此,枯草芽抱杆菌代谢组学研究具有重要意义,但目前有关其代谢组学的研究报道较少,在Meyer等Cz37
对枯草芽抱杆菌的代谢组分析研究中,并没有对前处理方法展开深入研究。哪些方法更适合于工业微
生物枯草芽抱杆菌的研究并没有相关的研究报道。本研究在淬灭、破碎提取和衍生3个重要环节对样
品前处理方法进行了比较研究,确定最适合枯草芽抱杆菌的代谢组学研究的样品前处理方法,为枯草芽
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关键词: 电解水;制氢;酸性离子液体;催化活性;活化能 发表时间: 2017-02-07 16:50:18
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关键词: 双脉冲激光诱导击穿光谱;最小二乘支持向量机;植物油;铬 发表时间: 2017-02-07 16:48:32
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关键词: 超高效合相色谱;蒸发光散射检测;蜂蜜;单糖;双糖 发表时间: 2017-02-07 16:45:27
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关键词: 头抱氨节;水解;电化学传感器;金属纳米粒子;伏安法 发表时间: 2017-02-07 16:44:36
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关键词: 化学发光;超灵敏检测;生化分析;综述 发表时间: 2017-02-07 16:43:33
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关键词: 微流控技术;药物筛选;细胞分析;综述 发表时间: 2017-02-07 16:30:49